Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ATP1A4Q13733 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ATP1A4Q13733 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ATP1A4Q13733 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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