Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms