Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
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