Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PPP1R1AQ13522 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms