Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms