Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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