Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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AP3B2Q13367 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP3B2Q13367 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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