Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB3BPQ13352 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms