Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RPA4Q13156 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPA4Q13156 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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