Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms