Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PTPRJQ12913 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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