Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms