Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms