Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNB2Q08289 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms