Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms