Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN12Q05209 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms