Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6Q03468 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms