Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HSF1Q00613 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms