Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZBED6P86452 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms