Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
RPS29P62273 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
RPS29P62273 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms