Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBX4P57082 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBX4P57082 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms