Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP7P55210 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP7P55210 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP7P55210 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP7P55210 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms