Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DAP3P51398 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms