Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIP4K2AP48426 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms