Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF9P41273 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms