Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPA3P35244 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA3P35244 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms