Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA3P32297 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms