Protein–RNA interactions for Protein: P31358

CD52, CAMPATH-1 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD52P31358 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD52P31358 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD52P31358 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD52P31358 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD52P31358 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD52P31358 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD52P31358 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD52P31358 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD52P31358 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD52P31358 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms