Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1P21675 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF1P21675 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF1P21675 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF1P21675 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF1P21675 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1P21675 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms