Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTPS1P17812 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTPS1P17812 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTPS1P17812 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms