Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DESP17661 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DESP17661 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DESP17661 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms