Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EPCAMP16422 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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