Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL2P13500 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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