Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYP2C9P11712 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms