Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TMIGD3P0DMS9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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