Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM58BPP0C7Q3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM58BPP0C7Q3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms