Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSL4O60488 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms