Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KIF1CO43896 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms