Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTSS1O43312 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms