Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLGNO14967 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLGNO14967 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms