Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNAP23O00161 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNAP23O00161 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms