Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP17L12C9JPN9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms