Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRRT4C9JH25 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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