Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PATL2C9JE40 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PATL2C9JE40 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms