Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GMNCA6NCL1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GMNCA6NCL1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms