Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XIRP2A4UGR9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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