Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EME2A4GXA9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms