Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms