Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCAF1Q9Y4B6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms