Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TMED7Q9Y3B3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TMED7Q9Y3B3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms